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鮭鱒遺傳育種與陸海接力養(yǎng)殖聯(lián)合攻關(guān)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)黃天晴、徐革鋒等人完成了烏蘇里白鮭（ Coregonus ussuriensis）全基因組的測(cè)序與組裝，繪制首個(gè)烏蘇里白鮭染色體水平基因組圖譜。相關(guān)成果“A chromosome-level genome assembly and evolutionary analysis of Coregonus ussuriensis Berg”發(fā)表在國際期刊《Scientific data》（IF：5.8，JCR1區(qū)，https://doi.org/10.1038/s41597-024-03642-0）。

烏蘇里白鮭屬鮭形目、鮭科，分布于我國黑龍江、俄羅斯西伯利亞等水域，其肉質(zhì)細(xì)膩、味道鮮美，具有較高的營養(yǎng)價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。由于生存環(huán)境的惡化和過度捕撈等因素，烏蘇里白鮭數(shù)量已經(jīng)出現(xiàn)了明顯的下降，并被列入了《中國瀕危動(dòng)物紅皮書》魚類卷。為加強(qiáng)烏蘇里白鮭的種質(zhì)資源保護(hù)和利用，為其人工繁育、分子標(biāo)記提供理論基礎(chǔ)，黑龍江所開展了烏蘇里白鮭的全基因組研究。該研究采用PacBio測(cè)序技術(shù)和Hi-C組裝技術(shù)，構(gòu)建了烏蘇里白鮭染色體水平參考基因組，基因組全長(zhǎng)2.51 Gb，contig N50長(zhǎng)度為4.27 Mb，scaffold N50長(zhǎng)度為62.20 Mb，注釋了43320個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因，平均長(zhǎng)度為19815.01 bp，每個(gè)基因的平均編碼序列長(zhǎng)度為1524.46 bp，平均外顯子數(shù)為8.68個(gè)。共線性分析發(fā)現(xiàn)烏蘇里白鮭與Coregonus sp. Balchen、Oncorhynchus mykiss、Salmo salar存在很強(qiáng)的同源性，全基因組復(fù)制（WGD）分別發(fā)生在同源位點(diǎn)突變率（Ks）0.1246、0.1246、0.2951、0.1305附近，在Ks值為0.1645時(shí)烏蘇里白鮭與大西洋鮭發(fā)生了物種分化。該基因組的組裝為開發(fā)烏蘇里白鮭生長(zhǎng)繁育、抗逆等經(jīng)濟(jì)性狀的分子標(biāo)記提供了重要的數(shù)據(jù)參考。

該研究得到中央級(jí)公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)（HSY202103M）、國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系（CARS-46）和中國水產(chǎn)科學(xué)研究院基本科研業(yè)務(wù)費(fèi) （2023TD96）項(xiàng)目資助。