鮭鱒遺傳育種與陸海接力養(yǎng)殖聯(lián)合攻關創(chuàng)新團隊黃天晴、徐革鋒等人完成了烏蘇里白鮭（ Coregonus ussuriensis）全基因組的測序與組裝，繪制首個烏蘇里白鮭染色體水平基因組圖譜。相關成果“A chromosome-level genome assembly and evolutionary analysis of Coregonus ussuriensis Berg”發(fā)表在國際期刊《Scientific data》（IF：5.8，JCR1區(qū)，https://doi.org/10.1038/s41597-024-03642-0）。

烏蘇里白鮭屬鮭形目、鮭科，分布于我國黑龍江、俄羅斯西伯利亞等水域，其肉質細膩、味道鮮美，具有較高的營養(yǎng)價值和經濟價值。由于生存環(huán)境的惡化和過度捕撈等因素，烏蘇里白鮭數量已經出現了明顯的下降，并被列入了《中國瀕危動物紅皮書》魚類卷。為加強烏蘇里白鮭的種質資源保護和利用，為其人工繁育、分子標記提供理論基礎，黑龍江所開展了烏蘇里白鮭的全基因組研究。該研究采用PacBio測序技術和Hi-C組裝技術，構建了烏蘇里白鮭染色體水平參考基因組，基因組全長2.51 Gb，contig N50長度為4.27 Mb，scaffold N50長度為62.20 Mb，注釋了43320個蛋白質編碼基因，平均長度為19815.01 bp，每個基因的平均編碼序列長度為1524.46 bp，平均外顯子數為8.68個。共線性分析發(fā)現烏蘇里白鮭與Coregonus sp. Balchen、Oncorhynchus mykiss、Salmo salar存在很強的同源性，全基因組復制（WGD）分別發(fā)生在同源位點突變率（Ks）0.1246、0.1246、0.2951、0.1305附近，在Ks值為0.1645時烏蘇里白鮭與大西洋鮭發(fā)生了物種分化。該基因組的組裝為開發(fā)烏蘇里白鮭生長繁育、抗逆等經濟性狀的分子標記提供了重要的數據參考。

該研究得到中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務費專項（HSY202103M）、國家現代農業(yè)產業(yè)技術體系（CARS-46）和中國水產科學研究院基本科研業(yè)務費 （2023TD96）項目資助。